O ponto de partida do Inquérito Policial: Família Tobias é o arquivamento de um inquérito real que investiga o autor, Ricardo Lisias. Ele descobre que os denunciantes foram João Varella, Cecilia Arbolave e Thiago Blumenthal, sócios da editora Lote 42, na mera intenção de ajudá-lo numa crise criativa e assim viabilizar a publicação de um livro. Lisias, então, solicita a abertura de uma investigação na Polícia Federal contra a editora. O novo inquérito traz declarações de um dos sócios, do próprio autor, provas, a árvore genealógica da família -- com um histórico que remonta ao século XIX --, e as respectivas histórias da quarta geração: do cineasta João Tobias (morto de forma trágica no Equador), do artista Fernando Tobias e da estilista Mariana Tobias.